Protein–RNA interactions for Protein: P42830

CXCL5, C-X-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL5P42830 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL5P42830 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CXCL5P42830 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CXCL5P42830 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CXCL5P42830 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CXCL5P42830 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL5P42830 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CXCL5P42830 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL5P42830 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL5P42830 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL5P42830 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CXCL5P42830 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL5P42830 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL5P42830 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL5P42830 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL5P42830 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL5P42830 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL5P42830 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL5P42830 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL5P42830 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL5P42830 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CXCL5P42830 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CXCL5P42830 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CXCL5P42830 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CXCL5P42830 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL5P42830 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CXCL5P42830 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CXCL5P42830 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL5P42830 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CXCL5P42830 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL5P42830 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CXCL5P42830 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CXCL5P42830 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CXCL5P42830 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CXCL5P42830 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CXCL5P42830 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL5P42830 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CXCL5P42830 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CXCL5P42830 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL5P42830 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL5P42830 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CXCL5P42830 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL5P42830 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CXCL5P42830 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CXCL5P42830 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL5P42830 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CXCL5P42830 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL5P42830 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL5P42830 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL5P42830 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CXCL5P42830 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL5P42830 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL5P42830 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CXCL5P42830 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CXCL5P42830 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL5P42830 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CXCL5P42830 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CXCL5P42830 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CXCL5P42830 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CXCL5P42830 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL5P42830 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL5P42830 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL5P42830 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL5P42830 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL5P42830 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CXCL5P42830 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CXCL5P42830 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CXCL5P42830 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CXCL5P42830 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CXCL5P42830 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CXCL5P42830 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CXCL5P42830 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CXCL5P42830 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CXCL5P42830 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CXCL5P42830 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CXCL5P42830 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CXCL5P42830 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CXCL5P42830 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CXCL5P42830 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL5P42830 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL5P42830 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CXCL5P42830 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL5P42830 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CXCL5P42830 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL5P42830 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL5P42830 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL5P42830 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL5P42830 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CXCL5P42830 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL5P42830 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL5P42830 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL5P42830 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL5P42830 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL5P42830 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL5P42830 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CXCL5P42830 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CXCL5P42830 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CXCL5P42830 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CXCL5P42830 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL5P42830 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.1 ms