Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPL35P42766 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL35P42766 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL35P42766 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL35P42766 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL35P42766 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPL35P42766 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL35P42766 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL35P42766 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL35P42766 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL35P42766 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL35P42766 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL35P42766 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL35P42766 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL35P42766 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL35P42766 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL35P42766 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL35P42766 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL35P42766 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL35P42766 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL35P42766 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPL35P42766 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL35P42766 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL35P42766 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL35P42766 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL35P42766 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL35P42766 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL35P42766 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL35P42766 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL35P42766 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL35P42766 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL35P42766 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL35P42766 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL35P42766 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL35P42766 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL35P42766 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL35P42766 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL35P42766 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL35P42766 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL35P42766 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL35P42766 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL35P42766 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL35P42766 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL35P42766 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL35P42766 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL35P42766 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL35P42766 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL35P42766 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL35P42766 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL35P42766 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL35P42766 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL35P42766 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL35P42766 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL35P42766 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL35P42766 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL35P42766 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL35P42766 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL35P42766 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL35P42766 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL35P42766 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL35P42766 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL35P42766 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPL35P42766 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL35P42766 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL35P42766 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL35P42766 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL35P42766 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL35P42766 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL35P42766 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL35P42766 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL35P42766 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL35P42766 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL35P42766 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL35P42766 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL35P42766 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL35P42766 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL35P42766 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL35P42766 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL35P42766 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL35P42766 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL35P42766 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL35P42766 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL35P42766 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL35P42766 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL35P42766 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL35P42766 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL35P42766 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL35P42766 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL35P42766 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL35P42766 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL35P42766 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL35P42766 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL35P42766 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL35P42766 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL35P42766 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL35P42766 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL35P42766 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL35P42766 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL35P42766 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL35P42766 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms