Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PGM1P36871 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PGM1P36871 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PGM1P36871 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PGM1P36871 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PGM1P36871 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PGM1P36871 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PGM1P36871 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PGM1P36871 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PGM1P36871 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
PGM1P36871 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PGM1P36871 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PGM1P36871 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PGM1P36871 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PGM1P36871 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PGM1P36871 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PGM1P36871 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PGM1P36871 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PGM1P36871 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PGM1P36871 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PGM1P36871 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PGM1P36871 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PGM1P36871 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PGM1P36871 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PGM1P36871 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PGM1P36871 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PGM1P36871 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PGM1P36871 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PGM1P36871 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PGM1P36871 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PGM1P36871 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PGM1P36871 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PGM1P36871 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PGM1P36871 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PGM1P36871 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PGM1P36871 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PGM1P36871 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PGM1P36871 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PGM1P36871 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PGM1P36871 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PGM1P36871 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PGM1P36871 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PGM1P36871 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PGM1P36871 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PGM1P36871 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PGM1P36871 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PGM1P36871 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PGM1P36871 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PGM1P36871 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PGM1P36871 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PGM1P36871 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PGM1P36871 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PGM1P36871 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PGM1P36871 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PGM1P36871 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PGM1P36871 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PGM1P36871 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PGM1P36871 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PGM1P36871 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PGM1P36871 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PGM1P36871 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PGM1P36871 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PGM1P36871 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PGM1P36871 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PGM1P36871 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PGM1P36871 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PGM1P36871 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PGM1P36871 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PGM1P36871 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PGM1P36871 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PGM1P36871 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PGM1P36871 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PGM1P36871 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PGM1P36871 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PGM1P36871 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PGM1P36871 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PGM1P36871 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PGM1P36871 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PGM1P36871 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PGM1P36871 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PGM1P36871 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PGM1P36871 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PGM1P36871 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PGM1P36871 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PGM1P36871 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PGM1P36871 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PGM1P36871 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PGM1P36871 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PGM1P36871 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PGM1P36871 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PGM1P36871 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PGM1P36871 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PGM1P36871 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PGM1P36871 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PGM1P36871 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PGM1P36871 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PGM1P36871 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PGM1P36871 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PGM1P36871 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PGM1P36871 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms