Protein–RNA interactions for Protein: P33991

MCM4, DNA replication licensing factor MCM4, humanhuman

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM4P33991 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
MCM4P33991 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
MCM4P33991 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
MCM4P33991 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
MCM4P33991 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
MCM4P33991 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
MCM4P33991 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
MCM4P33991 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
MCM4P33991 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
MCM4P33991 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
MCM4P33991 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
MCM4P33991 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
MCM4P33991 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
MCM4P33991 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
MCM4P33991 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
MCM4P33991 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
MCM4P33991 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
MCM4P33991 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
MCM4P33991 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
MCM4P33991 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
MCM4P33991 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
MCM4P33991 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
MCM4P33991 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
MCM4P33991 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
MCM4P33991 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
MCM4P33991 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
MCM4P33991 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
MCM4P33991 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
MCM4P33991 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
MCM4P33991 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
MCM4P33991 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
MCM4P33991 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
MCM4P33991 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
MCM4P33991 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
MCM4P33991 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
MCM4P33991 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
MCM4P33991 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
MCM4P33991 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
MCM4P33991 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
MCM4P33991 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
MCM4P33991 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
MCM4P33991 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
MCM4P33991 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
MCM4P33991 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
MCM4P33991 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
MCM4P33991 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
MCM4P33991 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
MCM4P33991 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
MCM4P33991 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
MCM4P33991 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
MCM4P33991 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
MCM4P33991 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
MCM4P33991 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
MCM4P33991 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
MCM4P33991 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
MCM4P33991 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
MCM4P33991 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
MCM4P33991 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
MCM4P33991 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
MCM4P33991 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
MCM4P33991 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
MCM4P33991 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
MCM4P33991 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
MCM4P33991 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
MCM4P33991 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
MCM4P33991 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
MCM4P33991 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
MCM4P33991 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
MCM4P33991 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
MCM4P33991 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
MCM4P33991 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
MCM4P33991 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
MCM4P33991 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
MCM4P33991 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
MCM4P33991 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
MCM4P33991 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
MCM4P33991 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
MCM4P33991 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
MCM4P33991 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
MCM4P33991 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
MCM4P33991 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
MCM4P33991 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
MCM4P33991 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
MCM4P33991 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
MCM4P33991 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
MCM4P33991 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
MCM4P33991 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
MCM4P33991 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
MCM4P33991 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
MCM4P33991 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
MCM4P33991 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
MCM4P33991 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
MCM4P33991 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
MCM4P33991 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
MCM4P33991 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
MCM4P33991 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
MCM4P33991 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
MCM4P33991 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
MCM4P33991 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
MCM4P33991 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms