Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
COL4A5P29400 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
COL4A5P29400 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
COL4A5P29400 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
COL4A5P29400 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
COL4A5P29400 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
COL4A5P29400 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
COL4A5P29400 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
COL4A5P29400 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
COL4A5P29400 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
COL4A5P29400 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
COL4A5P29400 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
COL4A5P29400 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
COL4A5P29400 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
COL4A5P29400 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
COL4A5P29400 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
COL4A5P29400 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
COL4A5P29400 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
COL4A5P29400 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
COL4A5P29400 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
COL4A5P29400 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
COL4A5P29400 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
COL4A5P29400 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
COL4A5P29400 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
COL4A5P29400 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
COL4A5P29400 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
COL4A5P29400 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
COL4A5P29400 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
COL4A5P29400 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
COL4A5P29400 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
COL4A5P29400 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC35.66■■■■□ 3.3
COL4A5P29400 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
COL4A5P29400 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
COL4A5P29400 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
COL4A5P29400 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
COL4A5P29400 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
COL4A5P29400 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
COL4A5P29400 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
COL4A5P29400 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
COL4A5P29400 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
COL4A5P29400 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
COL4A5P29400 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
COL4A5P29400 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
COL4A5P29400 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
COL4A5P29400 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
COL4A5P29400 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
COL4A5P29400 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
COL4A5P29400 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
COL4A5P29400 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
COL4A5P29400 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
COL4A5P29400 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
COL4A5P29400 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
COL4A5P29400 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
COL4A5P29400 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
COL4A5P29400 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
COL4A5P29400 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
COL4A5P29400 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
COL4A5P29400 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
COL4A5P29400 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
COL4A5P29400 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
COL4A5P29400 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
COL4A5P29400 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
COL4A5P29400 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
COL4A5P29400 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
COL4A5P29400 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
COL4A5P29400 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
COL4A5P29400 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
COL4A5P29400 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
COL4A5P29400 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC35■■■■□ 3.19
COL4A5P29400 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
COL4A5P29400 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
COL4A5P29400 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
COL4A5P29400 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
COL4A5P29400 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
COL4A5P29400 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
COL4A5P29400 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
COL4A5P29400 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
COL4A5P29400 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
COL4A5P29400 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
COL4A5P29400 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
COL4A5P29400 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
COL4A5P29400 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
COL4A5P29400 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
COL4A5P29400 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
COL4A5P29400 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
COL4A5P29400 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
COL4A5P29400 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
COL4A5P29400 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
COL4A5P29400 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
COL4A5P29400 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
COL4A5P29400 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
COL4A5P29400 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
COL4A5P29400 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
COL4A5P29400 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
COL4A5P29400 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
COL4A5P29400 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
COL4A5P29400 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
COL4A5P29400 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
COL4A5P29400 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
COL4A5P29400 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms