Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMA4P25789 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PSMA4P25789 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSMA4P25789 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PSMA4P25789 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PSMA4P25789 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSMA4P25789 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSMA4P25789 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSMA4P25789 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSMA4P25789 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMA4P25789 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSMA4P25789 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSMA4P25789 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSMA4P25789 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSMA4P25789 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSMA4P25789 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSMA4P25789 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSMA4P25789 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSMA4P25789 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMA4P25789 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMA4P25789 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PSMA4P25789 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSMA4P25789 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PSMA4P25789 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSMA4P25789 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMA4P25789 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMA4P25789 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSMA4P25789 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSMA4P25789 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSMA4P25789 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMA4P25789 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMA4P25789 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMA4P25789 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSMA4P25789 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSMA4P25789 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSMA4P25789 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PSMA4P25789 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PSMA4P25789 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSMA4P25789 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSMA4P25789 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSMA4P25789 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSMA4P25789 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSMA4P25789 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSMA4P25789 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSMA4P25789 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSMA4P25789 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSMA4P25789 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMA4P25789 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMA4P25789 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMA4P25789 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSMA4P25789 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSMA4P25789 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMA4P25789 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMA4P25789 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSMA4P25789 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSMA4P25789 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMA4P25789 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMA4P25789 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSMA4P25789 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSMA4P25789 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMA4P25789 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSMA4P25789 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMA4P25789 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMA4P25789 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMA4P25789 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PSMA4P25789 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSMA4P25789 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSMA4P25789 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMA4P25789 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSMA4P25789 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSMA4P25789 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMA4P25789 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMA4P25789 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMA4P25789 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMA4P25789 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSMA4P25789 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMA4P25789 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMA4P25789 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSMA4P25789 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSMA4P25789 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSMA4P25789 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PSMA4P25789 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMA4P25789 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMA4P25789 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMA4P25789 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSMA4P25789 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSMA4P25789 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMA4P25789 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMA4P25789 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSMA4P25789 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSMA4P25789 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSMA4P25789 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSMA4P25789 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSMA4P25789 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSMA4P25789 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSMA4P25789 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSMA4P25789 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMA4P25789 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSMA4P25789 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSMA4P25789 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms