Protein–RNA interactions for Protein: P21741

MDK, Midkine, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDKP21741 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MDKP21741 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDKP21741 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MDKP21741 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MDKP21741 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MDKP21741 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MDKP21741 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MDKP21741 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDKP21741 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDKP21741 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDKP21741 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDKP21741 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MDKP21741 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MDKP21741 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MDKP21741 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDKP21741 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDKP21741 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDKP21741 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDKP21741 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDKP21741 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDKP21741 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDKP21741 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDKP21741 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDKP21741 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDKP21741 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDKP21741 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MDKP21741 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MDKP21741 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MDKP21741 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MDKP21741 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MDKP21741 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDKP21741 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDKP21741 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDKP21741 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MDKP21741 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDKP21741 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDKP21741 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MDKP21741 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MDKP21741 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MDKP21741 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MDKP21741 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MDKP21741 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MDKP21741 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MDKP21741 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MDKP21741 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MDKP21741 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MDKP21741 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MDKP21741 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MDKP21741 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MDKP21741 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MDKP21741 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MDKP21741 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MDKP21741 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MDKP21741 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MDKP21741 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MDKP21741 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MDKP21741 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDKP21741 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDKP21741 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MDKP21741 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MDKP21741 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDKP21741 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDKP21741 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDKP21741 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDKP21741 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDKP21741 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDKP21741 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDKP21741 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDKP21741 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDKP21741 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MDKP21741 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MDKP21741 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MDKP21741 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MDKP21741 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MDKP21741 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MDKP21741 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MDKP21741 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MDKP21741 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MDKP21741 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MDKP21741 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MDKP21741 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MDKP21741 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MDKP21741 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MDKP21741 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MDKP21741 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MDKP21741 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MDKP21741 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MDKP21741 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MDKP21741 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MDKP21741 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MDKP21741 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MDKP21741 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MDKP21741 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MDKP21741 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MDKP21741 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDKP21741 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDKP21741 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDKP21741 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDKP21741 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDKP21741 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 708.5 ms