Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NF1P21359 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NF1P21359 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NF1P21359 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NF1P21359 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NF1P21359 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NF1P21359 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NF1P21359 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NF1P21359 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NF1P21359 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NF1P21359 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NF1P21359 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NF1P21359 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NF1P21359 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NF1P21359 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NF1P21359 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NF1P21359 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NF1P21359 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NF1P21359 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NF1P21359 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NF1P21359 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NF1P21359 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NF1P21359 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NF1P21359 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NF1P21359 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NF1P21359 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NF1P21359 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NF1P21359 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NF1P21359 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NF1P21359 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NF1P21359 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NF1P21359 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NF1P21359 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NF1P21359 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NF1P21359 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NF1P21359 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NF1P21359 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NF1P21359 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NF1P21359 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NF1P21359 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NF1P21359 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NF1P21359 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NF1P21359 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NF1P21359 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NF1P21359 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NF1P21359 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NF1P21359 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NF1P21359 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NF1P21359 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NF1P21359 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NF1P21359 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NF1P21359 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NF1P21359 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NF1P21359 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
NF1P21359 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NF1P21359 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NF1P21359 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NF1P21359 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NF1P21359 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NF1P21359 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NF1P21359 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NF1P21359 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NF1P21359 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NF1P21359 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NF1P21359 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NF1P21359 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NF1P21359 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NF1P21359 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NF1P21359 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NF1P21359 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NF1P21359 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NF1P21359 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NF1P21359 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NF1P21359 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NF1P21359 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NF1P21359 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NF1P21359 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NF1P21359 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NF1P21359 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NF1P21359 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NF1P21359 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NF1P21359 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NF1P21359 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NF1P21359 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NF1P21359 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NF1P21359 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NF1P21359 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NF1P21359 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NF1P21359 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NF1P21359 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NF1P21359 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NF1P21359 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NF1P21359 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NF1P21359 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NF1P21359 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NF1P21359 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NF1P21359 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NF1P21359 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NF1P21359 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NF1P21359 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms