Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB4AP20338 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB4AP20338 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB4AP20338 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB4AP20338 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB4AP20338 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB4AP20338 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB4AP20338 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB4AP20338 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB4AP20338 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB4AP20338 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB4AP20338 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB4AP20338 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB4AP20338 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB4AP20338 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB4AP20338 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB4AP20338 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB4AP20338 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB4AP20338 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB4AP20338 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB4AP20338 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB4AP20338 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB4AP20338 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB4AP20338 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB4AP20338 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB4AP20338 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB4AP20338 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB4AP20338 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB4AP20338 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB4AP20338 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB4AP20338 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB4AP20338 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB4AP20338 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB4AP20338 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB4AP20338 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB4AP20338 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB4AP20338 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB4AP20338 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB4AP20338 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB4AP20338 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB4AP20338 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB4AP20338 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB4AP20338 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB4AP20338 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB4AP20338 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB4AP20338 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB4AP20338 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB4AP20338 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB4AP20338 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB4AP20338 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB4AP20338 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB4AP20338 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB4AP20338 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB4AP20338 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB4AP20338 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB4AP20338 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB4AP20338 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB4AP20338 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB4AP20338 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB4AP20338 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB4AP20338 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB4AP20338 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB4AP20338 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB4AP20338 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB4AP20338 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB4AP20338 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB4AP20338 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB4AP20338 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB4AP20338 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB4AP20338 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB4AP20338 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB4AP20338 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB4AP20338 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB4AP20338 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB4AP20338 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB4AP20338 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB4AP20338 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB4AP20338 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB4AP20338 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB4AP20338 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB4AP20338 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB4AP20338 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB4AP20338 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB4AP20338 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB4AP20338 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB4AP20338 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB4AP20338 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB4AP20338 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB4AP20338 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB4AP20338 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB4AP20338 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB4AP20338 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB4AP20338 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB4AP20338 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB4AP20338 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB4AP20338 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB4AP20338 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB4AP20338 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB4AP20338 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB4AP20338 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms