Protein–RNA interactions for Protein: P18887

XRCC1, DNA repair protein XRCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC1P18887 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
XRCC1P18887 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
XRCC1P18887 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
XRCC1P18887 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
XRCC1P18887 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
XRCC1P18887 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
XRCC1P18887 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
XRCC1P18887 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
XRCC1P18887 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
XRCC1P18887 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
XRCC1P18887 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
XRCC1P18887 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
XRCC1P18887 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
XRCC1P18887 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
XRCC1P18887 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
XRCC1P18887 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
XRCC1P18887 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
XRCC1P18887 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
XRCC1P18887 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
XRCC1P18887 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
XRCC1P18887 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
XRCC1P18887 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
XRCC1P18887 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
XRCC1P18887 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
XRCC1P18887 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
XRCC1P18887 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
XRCC1P18887 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
XRCC1P18887 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
XRCC1P18887 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
XRCC1P18887 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
XRCC1P18887 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
XRCC1P18887 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
XRCC1P18887 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
XRCC1P18887 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
XRCC1P18887 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
XRCC1P18887 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
XRCC1P18887 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
XRCC1P18887 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
XRCC1P18887 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
XRCC1P18887 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
XRCC1P18887 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
XRCC1P18887 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
XRCC1P18887 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
XRCC1P18887 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
XRCC1P18887 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
XRCC1P18887 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
XRCC1P18887 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
XRCC1P18887 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
XRCC1P18887 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
XRCC1P18887 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
XRCC1P18887 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
XRCC1P18887 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
XRCC1P18887 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
XRCC1P18887 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
XRCC1P18887 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
XRCC1P18887 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
XRCC1P18887 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
XRCC1P18887 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
XRCC1P18887 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
XRCC1P18887 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
XRCC1P18887 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
XRCC1P18887 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
XRCC1P18887 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
XRCC1P18887 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
XRCC1P18887 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
XRCC1P18887 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
XRCC1P18887 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
XRCC1P18887 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
XRCC1P18887 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
XRCC1P18887 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
XRCC1P18887 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
XRCC1P18887 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
XRCC1P18887 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
XRCC1P18887 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
XRCC1P18887 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
XRCC1P18887 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
XRCC1P18887 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
XRCC1P18887 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
XRCC1P18887 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
XRCC1P18887 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
XRCC1P18887 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
XRCC1P18887 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
XRCC1P18887 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
XRCC1P18887 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
XRCC1P18887 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
XRCC1P18887 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
XRCC1P18887 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
XRCC1P18887 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
XRCC1P18887 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
XRCC1P18887 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
XRCC1P18887 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
XRCC1P18887 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
XRCC1P18887 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
XRCC1P18887 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
XRCC1P18887 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
XRCC1P18887 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
XRCC1P18887 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
XRCC1P18887 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
XRCC1P18887 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
XRCC1P18887 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195 ms