Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGAMP11215 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGAMP11215 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGAMP11215 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGAMP11215 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGAMP11215 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGAMP11215 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGAMP11215 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGAMP11215 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGAMP11215 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGAMP11215 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGAMP11215 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGAMP11215 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGAMP11215 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGAMP11215 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGAMP11215 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGAMP11215 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGAMP11215 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGAMP11215 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGAMP11215 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGAMP11215 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGAMP11215 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGAMP11215 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGAMP11215 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGAMP11215 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGAMP11215 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGAMP11215 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGAMP11215 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGAMP11215 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAMP11215 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAMP11215 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGAMP11215 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGAMP11215 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ITGAMP11215 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGAMP11215 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ITGAMP11215 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGAMP11215 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGAMP11215 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGAMP11215 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ITGAMP11215 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ITGAMP11215 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGAMP11215 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGAMP11215 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGAMP11215 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGAMP11215 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGAMP11215 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGAMP11215 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGAMP11215 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ITGAMP11215 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ITGAMP11215 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGAMP11215 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGAMP11215 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGAMP11215 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGAMP11215 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGAMP11215 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGAMP11215 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGAMP11215 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGAMP11215 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGAMP11215 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ITGAMP11215 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGAMP11215 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGAMP11215 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGAMP11215 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGAMP11215 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGAMP11215 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGAMP11215 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGAMP11215 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGAMP11215 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGAMP11215 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGAMP11215 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGAMP11215 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGAMP11215 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGAMP11215 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGAMP11215 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGAMP11215 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGAMP11215 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGAMP11215 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGAMP11215 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGAMP11215 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGAMP11215 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ITGAMP11215 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGAMP11215 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGAMP11215 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGAMP11215 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGAMP11215 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGAMP11215 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGAMP11215 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGAMP11215 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGAMP11215 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGAMP11215 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGAMP11215 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGAMP11215 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGAMP11215 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGAMP11215 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGAMP11215 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ITGAMP11215 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGAMP11215 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGAMP11215 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGAMP11215 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGAMP11215 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms