Protein–RNA interactions for Protein: P10827

THRA, Thyroid hormone receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP10827 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
THRAP10827 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
THRAP10827 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
THRAP10827 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
THRAP10827 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
THRAP10827 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
THRAP10827 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
THRAP10827 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
THRAP10827 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
THRAP10827 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
THRAP10827 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
THRAP10827 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
THRAP10827 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
THRAP10827 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
THRAP10827 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
THRAP10827 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
THRAP10827 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
THRAP10827 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
THRAP10827 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
THRAP10827 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
THRAP10827 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
THRAP10827 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
THRAP10827 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
THRAP10827 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
THRAP10827 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
THRAP10827 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
THRAP10827 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
THRAP10827 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
THRAP10827 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
THRAP10827 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
THRAP10827 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
THRAP10827 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
THRAP10827 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
THRAP10827 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
THRAP10827 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
THRAP10827 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
THRAP10827 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
THRAP10827 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
THRAP10827 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
THRAP10827 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
THRAP10827 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
THRAP10827 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
THRAP10827 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
THRAP10827 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
THRAP10827 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
THRAP10827 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
THRAP10827 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
THRAP10827 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
THRAP10827 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
THRAP10827 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
THRAP10827 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
THRAP10827 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
THRAP10827 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
THRAP10827 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
THRAP10827 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
THRAP10827 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
THRAP10827 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
THRAP10827 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
THRAP10827 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
THRAP10827 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
THRAP10827 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
THRAP10827 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
THRAP10827 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
THRAP10827 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
THRAP10827 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
THRAP10827 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
THRAP10827 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
THRAP10827 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
THRAP10827 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
THRAP10827 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
THRAP10827 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
THRAP10827 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
THRAP10827 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
THRAP10827 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
THRAP10827 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
THRAP10827 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
THRAP10827 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
THRAP10827 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
THRAP10827 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
THRAP10827 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
THRAP10827 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
THRAP10827 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
THRAP10827 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
THRAP10827 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
THRAP10827 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
THRAP10827 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
THRAP10827 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
THRAP10827 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
THRAP10827 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
THRAP10827 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
THRAP10827 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
THRAP10827 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
THRAP10827 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
THRAP10827 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
THRAP10827 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
THRAP10827 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
THRAP10827 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
THRAP10827 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
THRAP10827 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
THRAP10827 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms