Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRFP10586 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PTPRFP10586 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
PTPRFP10586 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
PTPRFP10586 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PTPRFP10586 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTPRFP10586 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTPRFP10586 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PTPRFP10586 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PTPRFP10586 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRFP10586 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
PTPRFP10586 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PTPRFP10586 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PTPRFP10586 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PTPRFP10586 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PTPRFP10586 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PTPRFP10586 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
PTPRFP10586 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTPRFP10586 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTPRFP10586 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTPRFP10586 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PTPRFP10586 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRFP10586 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPRFP10586 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPRFP10586 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRFP10586 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PTPRFP10586 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PTPRFP10586 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PTPRFP10586 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PTPRFP10586 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PTPRFP10586 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PTPRFP10586 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
PTPRFP10586 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PTPRFP10586 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
PTPRFP10586 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PTPRFP10586 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTPRFP10586 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRFP10586 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRFP10586 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTPRFP10586 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTPRFP10586 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
PTPRFP10586 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRFP10586 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRFP10586 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRFP10586 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PTPRFP10586 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PTPRFP10586 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PTPRFP10586 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PTPRFP10586 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PTPRFP10586 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PTPRFP10586 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PTPRFP10586 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTPRFP10586 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PTPRFP10586 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PTPRFP10586 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PTPRFP10586 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRFP10586 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRFP10586 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PTPRFP10586 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PTPRFP10586 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
PTPRFP10586 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRFP10586 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPRFP10586 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPRFP10586 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PTPRFP10586 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPRFP10586 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PTPRFP10586 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPRFP10586 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRFP10586 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRFP10586 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRFP10586 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRFP10586 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPRFP10586 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTPRFP10586 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PTPRFP10586 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRFP10586 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRFP10586 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTPRFP10586 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTPRFP10586 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRFP10586 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRFP10586 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRFP10586 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRFP10586 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPRFP10586 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTPRFP10586 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTPRFP10586 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTPRFP10586 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRFP10586 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PTPRFP10586 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33■■■□□ 2.87
PTPRFP10586 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33■■■□□ 2.87
PTPRFP10586 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRFP10586 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRFP10586 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTPRFP10586 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRFP10586 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRFP10586 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRFP10586 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRFP10586 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRFP10586 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRFP10586 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms