Protein–RNA interactions for Protein: P0CB38

PABPC4L, Polyadenylate-binding protein 4-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4LP0CB38 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PABPC4LP0CB38 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PABPC4LP0CB38 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PABPC4LP0CB38 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PABPC4LP0CB38 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PABPC4LP0CB38 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PABPC4LP0CB38 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PABPC4LP0CB38 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PABPC4LP0CB38 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PABPC4LP0CB38 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PABPC4LP0CB38 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PABPC4LP0CB38 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PABPC4LP0CB38 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PABPC4LP0CB38 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PABPC4LP0CB38 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PABPC4LP0CB38 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PABPC4LP0CB38 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PABPC4LP0CB38 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PABPC4LP0CB38 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PABPC4LP0CB38 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PABPC4LP0CB38 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PABPC4LP0CB38 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PABPC4LP0CB38 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PABPC4LP0CB38 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PABPC4LP0CB38 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PABPC4LP0CB38 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PABPC4LP0CB38 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PABPC4LP0CB38 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PABPC4LP0CB38 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PABPC4LP0CB38 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PABPC4LP0CB38 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PABPC4LP0CB38 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PABPC4LP0CB38 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PABPC4LP0CB38 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PABPC4LP0CB38 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PABPC4LP0CB38 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PABPC4LP0CB38 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PABPC4LP0CB38 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PABPC4LP0CB38 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PABPC4LP0CB38 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PABPC4LP0CB38 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PABPC4LP0CB38 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PABPC4LP0CB38 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PABPC4LP0CB38 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PABPC4LP0CB38 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PABPC4LP0CB38 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PABPC4LP0CB38 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PABPC4LP0CB38 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PABPC4LP0CB38 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PABPC4LP0CB38 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PABPC4LP0CB38 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PABPC4LP0CB38 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PABPC4LP0CB38 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PABPC4LP0CB38 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PABPC4LP0CB38 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PABPC4LP0CB38 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PABPC4LP0CB38 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PABPC4LP0CB38 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PABPC4LP0CB38 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PABPC4LP0CB38 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PABPC4LP0CB38 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PABPC4LP0CB38 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PABPC4LP0CB38 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PABPC4LP0CB38 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PABPC4LP0CB38 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PABPC4LP0CB38 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PABPC4LP0CB38 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PABPC4LP0CB38 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PABPC4LP0CB38 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PABPC4LP0CB38 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PABPC4LP0CB38 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PABPC4LP0CB38 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PABPC4LP0CB38 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PABPC4LP0CB38 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PABPC4LP0CB38 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PABPC4LP0CB38 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PABPC4LP0CB38 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PABPC4LP0CB38 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PABPC4LP0CB38 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PABPC4LP0CB38 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PABPC4LP0CB38 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PABPC4LP0CB38 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PABPC4LP0CB38 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PABPC4LP0CB38 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PABPC4LP0CB38 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PABPC4LP0CB38 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PABPC4LP0CB38 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PABPC4LP0CB38 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PABPC4LP0CB38 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PABPC4LP0CB38 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PABPC4LP0CB38 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PABPC4LP0CB38 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PABPC4LP0CB38 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PABPC4LP0CB38 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PABPC4LP0CB38 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PABPC4LP0CB38 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PABPC4LP0CB38 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PABPC4LP0CB38 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PABPC4LP0CB38 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PABPC4LP0CB38 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms