Protein–RNA interactions for Protein: P0C7T7

FRMD6-AS1, Putative uncharacterized protein FRMD6-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD6-AS1P0C7T7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD6-AS1P0C7T7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD6-AS1P0C7T7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD6-AS1P0C7T7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMD6-AS1P0C7T7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMD6-AS1P0C7T7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMD6-AS1P0C7T7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRMD6-AS1P0C7T7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRMD6-AS1P0C7T7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FRMD6-AS1P0C7T7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD6-AS1P0C7T7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD6-AS1P0C7T7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD6-AS1P0C7T7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD6-AS1P0C7T7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD6-AS1P0C7T7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FRMD6-AS1P0C7T7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FRMD6-AS1P0C7T7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD6-AS1P0C7T7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD6-AS1P0C7T7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD6-AS1P0C7T7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD6-AS1P0C7T7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD6-AS1P0C7T7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD6-AS1P0C7T7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD6-AS1P0C7T7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD6-AS1P0C7T7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD6-AS1P0C7T7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FRMD6-AS1P0C7T7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD6-AS1P0C7T7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD6-AS1P0C7T7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD6-AS1P0C7T7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRMD6-AS1P0C7T7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD6-AS1P0C7T7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD6-AS1P0C7T7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMD6-AS1P0C7T7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD6-AS1P0C7T7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMD6-AS1P0C7T7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMD6-AS1P0C7T7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMD6-AS1P0C7T7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMD6-AS1P0C7T7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMD6-AS1P0C7T7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMD6-AS1P0C7T7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMD6-AS1P0C7T7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMD6-AS1P0C7T7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRMD6-AS1P0C7T7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMD6-AS1P0C7T7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMD6-AS1P0C7T7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMD6-AS1P0C7T7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMD6-AS1P0C7T7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMD6-AS1P0C7T7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FRMD6-AS1P0C7T7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FRMD6-AS1P0C7T7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMD6-AS1P0C7T7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMD6-AS1P0C7T7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMD6-AS1P0C7T7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMD6-AS1P0C7T7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMD6-AS1P0C7T7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMD6-AS1P0C7T7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMD6-AS1P0C7T7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMD6-AS1P0C7T7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMD6-AS1P0C7T7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMD6-AS1P0C7T7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMD6-AS1P0C7T7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMD6-AS1P0C7T7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FRMD6-AS1P0C7T7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMD6-AS1P0C7T7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMD6-AS1P0C7T7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMD6-AS1P0C7T7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMD6-AS1P0C7T7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMD6-AS1P0C7T7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMD6-AS1P0C7T7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMD6-AS1P0C7T7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMD6-AS1P0C7T7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMD6-AS1P0C7T7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMD6-AS1P0C7T7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMD6-AS1P0C7T7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FRMD6-AS1P0C7T7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMD6-AS1P0C7T7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMD6-AS1P0C7T7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMD6-AS1P0C7T7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FRMD6-AS1P0C7T7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FRMD6-AS1P0C7T7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FRMD6-AS1P0C7T7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FRMD6-AS1P0C7T7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FRMD6-AS1P0C7T7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMD6-AS1P0C7T7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMD6-AS1P0C7T7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMD6-AS1P0C7T7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMD6-AS1P0C7T7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD6-AS1P0C7T7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD6-AS1P0C7T7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMD6-AS1P0C7T7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMD6-AS1P0C7T7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FRMD6-AS1P0C7T7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMD6-AS1P0C7T7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMD6-AS1P0C7T7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMD6-AS1P0C7T7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMD6-AS1P0C7T7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMD6-AS1P0C7T7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMD6-AS1P0C7T7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMD6-AS1P0C7T7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms