Protein–RNA interactions for Protein: P0C7T7

FRMD6-AS1, Putative uncharacterized protein FRMD6-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD6-AS1P0C7T7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FRMD6-AS1P0C7T7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMD6-AS1P0C7T7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRMD6-AS1P0C7T7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMD6-AS1P0C7T7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMD6-AS1P0C7T7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMD6-AS1P0C7T7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FRMD6-AS1P0C7T7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FRMD6-AS1P0C7T7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FRMD6-AS1P0C7T7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FRMD6-AS1P0C7T7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FRMD6-AS1P0C7T7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMD6-AS1P0C7T7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FRMD6-AS1P0C7T7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRMD6-AS1P0C7T7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FRMD6-AS1P0C7T7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMD6-AS1P0C7T7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FRMD6-AS1P0C7T7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FRMD6-AS1P0C7T7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FRMD6-AS1P0C7T7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FRMD6-AS1P0C7T7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMD6-AS1P0C7T7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRMD6-AS1P0C7T7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRMD6-AS1P0C7T7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FRMD6-AS1P0C7T7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRMD6-AS1P0C7T7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMD6-AS1P0C7T7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMD6-AS1P0C7T7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMD6-AS1P0C7T7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMD6-AS1P0C7T7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FRMD6-AS1P0C7T7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FRMD6-AS1P0C7T7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMD6-AS1P0C7T7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMD6-AS1P0C7T7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FRMD6-AS1P0C7T7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMD6-AS1P0C7T7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMD6-AS1P0C7T7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRMD6-AS1P0C7T7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRMD6-AS1P0C7T7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FRMD6-AS1P0C7T7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMD6-AS1P0C7T7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMD6-AS1P0C7T7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMD6-AS1P0C7T7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMD6-AS1P0C7T7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMD6-AS1P0C7T7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMD6-AS1P0C7T7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMD6-AS1P0C7T7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMD6-AS1P0C7T7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FRMD6-AS1P0C7T7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FRMD6-AS1P0C7T7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FRMD6-AS1P0C7T7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FRMD6-AS1P0C7T7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMD6-AS1P0C7T7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRMD6-AS1P0C7T7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD6-AS1P0C7T7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD6-AS1P0C7T7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMD6-AS1P0C7T7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMD6-AS1P0C7T7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMD6-AS1P0C7T7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FRMD6-AS1P0C7T7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMD6-AS1P0C7T7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMD6-AS1P0C7T7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMD6-AS1P0C7T7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMD6-AS1P0C7T7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMD6-AS1P0C7T7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMD6-AS1P0C7T7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMD6-AS1P0C7T7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMD6-AS1P0C7T7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMD6-AS1P0C7T7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMD6-AS1P0C7T7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMD6-AS1P0C7T7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMD6-AS1P0C7T7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMD6-AS1P0C7T7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMD6-AS1P0C7T7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FRMD6-AS1P0C7T7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FRMD6-AS1P0C7T7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD6-AS1P0C7T7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD6-AS1P0C7T7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD6-AS1P0C7T7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMD6-AS1P0C7T7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMD6-AS1P0C7T7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMD6-AS1P0C7T7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMD6-AS1P0C7T7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FRMD6-AS1P0C7T7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMD6-AS1P0C7T7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMD6-AS1P0C7T7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMD6-AS1P0C7T7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMD6-AS1P0C7T7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMD6-AS1P0C7T7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMD6-AS1P0C7T7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMD6-AS1P0C7T7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMD6-AS1P0C7T7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMD6-AS1P0C7T7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FRMD6-AS1P0C7T7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMD6-AS1P0C7T7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMD6-AS1P0C7T7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMD6-AS1P0C7T7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FRMD6-AS1P0C7T7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FRMD6-AS1P0C7T7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD6-AS1P0C7T7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms