Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
C4AP0C0L4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
C4AP0C0L4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
C4AP0C0L4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
C4AP0C0L4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
C4AP0C0L4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
C4AP0C0L4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
C4AP0C0L4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
C4AP0C0L4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
C4AP0C0L4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
C4AP0C0L4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
C4AP0C0L4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
C4AP0C0L4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
C4AP0C0L4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
C4AP0C0L4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
C4AP0C0L4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
C4AP0C0L4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
C4AP0C0L4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
C4AP0C0L4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
C4AP0C0L4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
C4AP0C0L4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
C4AP0C0L4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
C4AP0C0L4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
C4AP0C0L4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
C4AP0C0L4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
C4AP0C0L4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
C4AP0C0L4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
C4AP0C0L4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
C4AP0C0L4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC37.1■■■■□ 3.53
C4AP0C0L4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
C4AP0C0L4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
C4AP0C0L4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
C4AP0C0L4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
C4AP0C0L4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
C4AP0C0L4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
C4AP0C0L4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
C4AP0C0L4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
C4AP0C0L4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
C4AP0C0L4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
C4AP0C0L4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
C4AP0C0L4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
C4AP0C0L4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
C4AP0C0L4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
C4AP0C0L4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
C4AP0C0L4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
C4AP0C0L4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
C4AP0C0L4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
C4AP0C0L4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
C4AP0C0L4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
C4AP0C0L4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
C4AP0C0L4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
C4AP0C0L4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
C4AP0C0L4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
C4AP0C0L4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
C4AP0C0L4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
C4AP0C0L4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
C4AP0C0L4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
C4AP0C0L4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
C4AP0C0L4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
C4AP0C0L4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
C4AP0C0L4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
C4AP0C0L4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
C4AP0C0L4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
C4AP0C0L4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
C4AP0C0L4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
C4AP0C0L4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
C4AP0C0L4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
C4AP0C0L4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
C4AP0C0L4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
C4AP0C0L4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
C4AP0C0L4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
C4AP0C0L4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
C4AP0C0L4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
C4AP0C0L4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
C4AP0C0L4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
C4AP0C0L4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
C4AP0C0L4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
C4AP0C0L4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
C4AP0C0L4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
C4AP0C0L4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
C4AP0C0L4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
C4AP0C0L4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
C4AP0C0L4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
C4AP0C0L4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
C4AP0C0L4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
C4AP0C0L4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
C4AP0C0L4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
C4AP0C0L4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
C4AP0C0L4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
C4AP0C0L4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
C4AP0C0L4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
C4AP0C0L4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
C4AP0C0L4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
C4AP0C0L4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
C4AP0C0L4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
C4AP0C0L4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
C4AP0C0L4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
C4AP0C0L4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
C4AP0C0L4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
C4AP0C0L4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms