Protein–RNA interactions for Protein: P06858

LPL, Lipoprotein lipase, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPLP06858 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LPLP06858 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LPLP06858 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LPLP06858 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LPLP06858 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LPLP06858 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LPLP06858 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LPLP06858 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LPLP06858 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LPLP06858 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LPLP06858 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LPLP06858 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LPLP06858 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LPLP06858 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LPLP06858 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LPLP06858 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LPLP06858 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LPLP06858 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LPLP06858 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LPLP06858 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LPLP06858 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LPLP06858 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LPLP06858 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LPLP06858 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LPLP06858 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LPLP06858 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LPLP06858 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LPLP06858 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPLP06858 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPLP06858 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LPLP06858 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LPLP06858 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LPLP06858 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LPLP06858 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPLP06858 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPLP06858 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPLP06858 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LPLP06858 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LPLP06858 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LPLP06858 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LPLP06858 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LPLP06858 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LPLP06858 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LPLP06858 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LPLP06858 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LPLP06858 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LPLP06858 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LPLP06858 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPLP06858 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPLP06858 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LPLP06858 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LPLP06858 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LPLP06858 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LPLP06858 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LPLP06858 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LPLP06858 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LPLP06858 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LPLP06858 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LPLP06858 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LPLP06858 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LPLP06858 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LPLP06858 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LPLP06858 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LPLP06858 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LPLP06858 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LPLP06858 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LPLP06858 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LPLP06858 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LPLP06858 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LPLP06858 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LPLP06858 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LPLP06858 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LPLP06858 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LPLP06858 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LPLP06858 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPLP06858 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LPLP06858 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LPLP06858 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LPLP06858 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LPLP06858 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LPLP06858 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LPLP06858 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LPLP06858 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LPLP06858 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LPLP06858 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LPLP06858 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LPLP06858 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LPLP06858 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LPLP06858 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LPLP06858 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LPLP06858 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LPLP06858 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LPLP06858 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LPLP06858 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LPLP06858 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LPLP06858 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LPLP06858 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LPLP06858 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LPLP06858 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LPLP06858 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms