Protein–RNA interactions for Protein: P04440

HLA-DPB1, HLA class II histocompatibility antigen, DP beta 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPB1P04440 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HLA-DPB1P04440 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HLA-DPB1P04440 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HLA-DPB1P04440 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HLA-DPB1P04440 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HLA-DPB1P04440 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HLA-DPB1P04440 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLA-DPB1P04440 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLA-DPB1P04440 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-DPB1P04440 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HLA-DPB1P04440 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HLA-DPB1P04440 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLA-DPB1P04440 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HLA-DPB1P04440 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HLA-DPB1P04440 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HLA-DPB1P04440 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HLA-DPB1P04440 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HLA-DPB1P04440 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HLA-DPB1P04440 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HLA-DPB1P04440 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HLA-DPB1P04440 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HLA-DPB1P04440 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HLA-DPB1P04440 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HLA-DPB1P04440 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HLA-DPB1P04440 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HLA-DPB1P04440 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLA-DPB1P04440 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HLA-DPB1P04440 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HLA-DPB1P04440 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HLA-DPB1P04440 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLA-DPB1P04440 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLA-DPB1P04440 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HLA-DPB1P04440 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HLA-DPB1P04440 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HLA-DPB1P04440 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-DPB1P04440 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLA-DPB1P04440 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLA-DPB1P04440 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-DPB1P04440 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-DPB1P04440 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-DPB1P04440 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-DPB1P04440 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-DPB1P04440 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-DPB1P04440 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-DPB1P04440 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-DPB1P04440 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-DPB1P04440 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-DPB1P04440 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-DPB1P04440 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-DPB1P04440 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-DPB1P04440 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-DPB1P04440 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-DPB1P04440 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-DPB1P04440 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-DPB1P04440 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HLA-DPB1P04440 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HLA-DPB1P04440 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HLA-DPB1P04440 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-DPB1P04440 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-DPB1P04440 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HLA-DPB1P04440 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HLA-DPB1P04440 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HLA-DPB1P04440 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-DPB1P04440 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-DPB1P04440 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-DPB1P04440 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLA-DPB1P04440 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLA-DPB1P04440 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLA-DPB1P04440 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-DPB1P04440 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-DPB1P04440 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HLA-DPB1P04440 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HLA-DPB1P04440 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HLA-DPB1P04440 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HLA-DPB1P04440 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HLA-DPB1P04440 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HLA-DPB1P04440 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HLA-DPB1P04440 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HLA-DPB1P04440 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HLA-DPB1P04440 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-DPB1P04440 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-DPB1P04440 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-DPB1P04440 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HLA-DPB1P04440 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HLA-DPB1P04440 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-DPB1P04440 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-DPB1P04440 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-DPB1P04440 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-DPB1P04440 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HLA-DPB1P04440 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DPB1P04440 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DPB1P04440 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DPB1P04440 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-DPB1P04440 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-DPB1P04440 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-DPB1P04440 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HLA-DPB1P04440 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HLA-DPB1P04440 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HLA-DPB1P04440 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HLA-DPB1P04440 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.7 ms