Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOA1P02647 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOA1P02647 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOA1P02647 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOA1P02647 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
APOA1P02647 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOA1P02647 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOA1P02647 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOA1P02647 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOA1P02647 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOA1P02647 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOA1P02647 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOA1P02647 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOA1P02647 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOA1P02647 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOA1P02647 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOA1P02647 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOA1P02647 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOA1P02647 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOA1P02647 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOA1P02647 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOA1P02647 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOA1P02647 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOA1P02647 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOA1P02647 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOA1P02647 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOA1P02647 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
APOA1P02647 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOA1P02647 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOA1P02647 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOA1P02647 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOA1P02647 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOA1P02647 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOA1P02647 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOA1P02647 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOA1P02647 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOA1P02647 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOA1P02647 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
APOA1P02647 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
APOA1P02647 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOA1P02647 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOA1P02647 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOA1P02647 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOA1P02647 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOA1P02647 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOA1P02647 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APOA1P02647 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOA1P02647 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOA1P02647 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOA1P02647 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APOA1P02647 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APOA1P02647 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOA1P02647 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOA1P02647 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOA1P02647 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOA1P02647 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOA1P02647 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
APOA1P02647 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOA1P02647 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOA1P02647 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOA1P02647 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOA1P02647 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
APOA1P02647 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOA1P02647 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOA1P02647 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOA1P02647 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOA1P02647 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOA1P02647 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOA1P02647 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOA1P02647 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOA1P02647 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25■■□□□ 1.59
APOA1P02647 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOA1P02647 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOA1P02647 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOA1P02647 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOA1P02647 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOA1P02647 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOA1P02647 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOA1P02647 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOA1P02647 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOA1P02647 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOA1P02647 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOA1P02647 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOA1P02647 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOA1P02647 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOA1P02647 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOA1P02647 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOA1P02647 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOA1P02647 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOA1P02647 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOA1P02647 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOA1P02647 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOA1P02647 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOA1P02647 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOA1P02647 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
APOA1P02647 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOA1P02647 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOA1P02647 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOA1P02647 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOA1P02647 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms