Protein–RNA interactions for Protein: P01850

TRBC1, T-cell receptor beta-1 chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC1P01850 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRBC1P01850 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRBC1P01850 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRBC1P01850 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRBC1P01850 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRBC1P01850 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRBC1P01850 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRBC1P01850 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRBC1P01850 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TRBC1P01850 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRBC1P01850 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRBC1P01850 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRBC1P01850 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRBC1P01850 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRBC1P01850 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRBC1P01850 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRBC1P01850 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRBC1P01850 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRBC1P01850 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRBC1P01850 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRBC1P01850 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRBC1P01850 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRBC1P01850 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRBC1P01850 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TRBC1P01850 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRBC1P01850 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRBC1P01850 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRBC1P01850 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRBC1P01850 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRBC1P01850 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRBC1P01850 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRBC1P01850 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRBC1P01850 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRBC1P01850 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRBC1P01850 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRBC1P01850 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRBC1P01850 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRBC1P01850 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRBC1P01850 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRBC1P01850 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRBC1P01850 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRBC1P01850 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TRBC1P01850 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRBC1P01850 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRBC1P01850 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRBC1P01850 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRBC1P01850 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRBC1P01850 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRBC1P01850 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRBC1P01850 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRBC1P01850 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRBC1P01850 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRBC1P01850 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRBC1P01850 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRBC1P01850 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRBC1P01850 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRBC1P01850 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRBC1P01850 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRBC1P01850 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRBC1P01850 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRBC1P01850 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRBC1P01850 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRBC1P01850 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRBC1P01850 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRBC1P01850 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRBC1P01850 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRBC1P01850 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRBC1P01850 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRBC1P01850 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRBC1P01850 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRBC1P01850 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRBC1P01850 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRBC1P01850 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRBC1P01850 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRBC1P01850 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRBC1P01850 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRBC1P01850 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRBC1P01850 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRBC1P01850 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRBC1P01850 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRBC1P01850 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRBC1P01850 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRBC1P01850 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRBC1P01850 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRBC1P01850 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRBC1P01850 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRBC1P01850 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRBC1P01850 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRBC1P01850 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRBC1P01850 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRBC1P01850 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRBC1P01850 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRBC1P01850 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRBC1P01850 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRBC1P01850 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRBC1P01850 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRBC1P01850 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRBC1P01850 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRBC1P01850 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRBC1P01850 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms