Protein–RNA interactions for Protein: P01133

EGF, Pro-epidermal growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFP01133 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
EGFP01133 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
EGFP01133 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
EGFP01133 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
EGFP01133 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
EGFP01133 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
EGFP01133 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
EGFP01133 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
EGFP01133 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
EGFP01133 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
EGFP01133 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
EGFP01133 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EGFP01133 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
EGFP01133 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EGFP01133 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EGFP01133 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EGFP01133 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
EGFP01133 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EGFP01133 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EGFP01133 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EGFP01133 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
EGFP01133 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EGFP01133 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EGFP01133 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
EGFP01133 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EGFP01133 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
EGFP01133 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
EGFP01133 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
EGFP01133 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
EGFP01133 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
EGFP01133 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
EGFP01133 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
EGFP01133 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
EGFP01133 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
EGFP01133 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EGFP01133 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EGFP01133 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
EGFP01133 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EGFP01133 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
EGFP01133 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
EGFP01133 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
EGFP01133 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
EGFP01133 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EGFP01133 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
EGFP01133 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
EGFP01133 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
EGFP01133 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EGFP01133 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EGFP01133 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EGFP01133 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EGFP01133 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EGFP01133 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EGFP01133 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EGFP01133 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EGFP01133 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EGFP01133 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EGFP01133 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
EGFP01133 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EGFP01133 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EGFP01133 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EGFP01133 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EGFP01133 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EGFP01133 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
EGFP01133 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EGFP01133 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EGFP01133 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EGFP01133 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EGFP01133 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EGFP01133 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EGFP01133 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EGFP01133 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EGFP01133 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EGFP01133 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EGFP01133 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EGFP01133 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
EGFP01133 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
EGFP01133 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EGFP01133 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EGFP01133 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EGFP01133 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EGFP01133 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EGFP01133 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EGFP01133 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EGFP01133 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EGFP01133 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
EGFP01133 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EGFP01133 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EGFP01133 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EGFP01133 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EGFP01133 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EGFP01133 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EGFP01133 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EGFP01133 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EGFP01133 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EGFP01133 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EGFP01133 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EGFP01133 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EGFP01133 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
EGFP01133 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
EGFP01133 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 235.5 ms