Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYF2O95926 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYF2O95926 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYF2O95926 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SYF2O95926 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYF2O95926 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SYF2O95926 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SYF2O95926 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYF2O95926 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYF2O95926 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYF2O95926 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYF2O95926 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYF2O95926 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYF2O95926 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYF2O95926 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SYF2O95926 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SYF2O95926 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYF2O95926 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYF2O95926 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYF2O95926 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYF2O95926 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYF2O95926 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYF2O95926 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYF2O95926 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SYF2O95926 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SYF2O95926 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYF2O95926 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYF2O95926 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYF2O95926 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYF2O95926 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYF2O95926 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SYF2O95926 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYF2O95926 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYF2O95926 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYF2O95926 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYF2O95926 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYF2O95926 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYF2O95926 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYF2O95926 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYF2O95926 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYF2O95926 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYF2O95926 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYF2O95926 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYF2O95926 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYF2O95926 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYF2O95926 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYF2O95926 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYF2O95926 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYF2O95926 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYF2O95926 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYF2O95926 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYF2O95926 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SYF2O95926 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SYF2O95926 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYF2O95926 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYF2O95926 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYF2O95926 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SYF2O95926 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYF2O95926 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYF2O95926 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYF2O95926 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYF2O95926 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYF2O95926 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYF2O95926 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYF2O95926 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYF2O95926 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYF2O95926 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYF2O95926 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYF2O95926 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYF2O95926 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYF2O95926 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SYF2O95926 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYF2O95926 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYF2O95926 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYF2O95926 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SYF2O95926 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYF2O95926 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYF2O95926 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYF2O95926 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYF2O95926 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYF2O95926 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYF2O95926 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYF2O95926 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYF2O95926 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYF2O95926 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYF2O95926 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYF2O95926 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYF2O95926 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYF2O95926 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYF2O95926 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYF2O95926 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYF2O95926 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYF2O95926 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYF2O95926 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SYF2O95926 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYF2O95926 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SYF2O95926 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYF2O95926 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SYF2O95926 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SYF2O95926 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms