Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TSPAN13O95857 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSPAN13O95857 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TSPAN13O95857 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSPAN13O95857 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TSPAN13O95857 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSPAN13O95857 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSPAN13O95857 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TSPAN13O95857 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TSPAN13O95857 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSPAN13O95857 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSPAN13O95857 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TSPAN13O95857 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSPAN13O95857 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TSPAN13O95857 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSPAN13O95857 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TSPAN13O95857 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TSPAN13O95857 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TSPAN13O95857 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TSPAN13O95857 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TSPAN13O95857 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TSPAN13O95857 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TSPAN13O95857 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TSPAN13O95857 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TSPAN13O95857 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TSPAN13O95857 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TSPAN13O95857 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TSPAN13O95857 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TSPAN13O95857 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TSPAN13O95857 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TSPAN13O95857 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TSPAN13O95857 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TSPAN13O95857 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TSPAN13O95857 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TSPAN13O95857 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TSPAN13O95857 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TSPAN13O95857 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TSPAN13O95857 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TSPAN13O95857 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TSPAN13O95857 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TSPAN13O95857 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TSPAN13O95857 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TSPAN13O95857 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TSPAN13O95857 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TSPAN13O95857 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TSPAN13O95857 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TSPAN13O95857 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TSPAN13O95857 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TSPAN13O95857 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TSPAN13O95857 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TSPAN13O95857 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPAN13O95857 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPAN13O95857 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPAN13O95857 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPAN13O95857 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSPAN13O95857 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSPAN13O95857 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN13O95857 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN13O95857 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN13O95857 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPAN13O95857 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TSPAN13O95857 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TSPAN13O95857 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN13O95857 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TSPAN13O95857 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSPAN13O95857 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSPAN13O95857 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSPAN13O95857 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSPAN13O95857 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSPAN13O95857 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSPAN13O95857 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSPAN13O95857 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TSPAN13O95857 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TSPAN13O95857 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TSPAN13O95857 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TSPAN13O95857 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TSPAN13O95857 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TSPAN13O95857 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TSPAN13O95857 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TSPAN13O95857 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TSPAN13O95857 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TSPAN13O95857 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSPAN13O95857 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TSPAN13O95857 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TSPAN13O95857 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TSPAN13O95857 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TSPAN13O95857 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TSPAN13O95857 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TSPAN13O95857 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TSPAN13O95857 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TSPAN13O95857 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TSPAN13O95857 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TSPAN13O95857 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TSPAN13O95857 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TSPAN13O95857 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TSPAN13O95857 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TSPAN13O95857 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TSPAN13O95857 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TSPAN13O95857 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSPAN13O95857 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms