Protein–RNA interactions for Protein: O94805

ACTL6B, Actin-like protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTL6BO94805 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTL6BO94805 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTL6BO94805 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTL6BO94805 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTL6BO94805 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTL6BO94805 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTL6BO94805 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTL6BO94805 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTL6BO94805 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTL6BO94805 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTL6BO94805 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTL6BO94805 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTL6BO94805 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTL6BO94805 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTL6BO94805 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTL6BO94805 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTL6BO94805 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTL6BO94805 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTL6BO94805 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTL6BO94805 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTL6BO94805 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTL6BO94805 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTL6BO94805 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTL6BO94805 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTL6BO94805 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACTL6BO94805 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACTL6BO94805 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTL6BO94805 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACTL6BO94805 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTL6BO94805 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACTL6BO94805 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTL6BO94805 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTL6BO94805 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTL6BO94805 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTL6BO94805 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTL6BO94805 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTL6BO94805 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTL6BO94805 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTL6BO94805 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTL6BO94805 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTL6BO94805 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTL6BO94805 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTL6BO94805 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTL6BO94805 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTL6BO94805 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTL6BO94805 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTL6BO94805 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTL6BO94805 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTL6BO94805 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTL6BO94805 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTL6BO94805 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTL6BO94805 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTL6BO94805 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTL6BO94805 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTL6BO94805 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTL6BO94805 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTL6BO94805 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACTL6BO94805 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTL6BO94805 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTL6BO94805 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTL6BO94805 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTL6BO94805 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTL6BO94805 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTL6BO94805 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTL6BO94805 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTL6BO94805 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTL6BO94805 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTL6BO94805 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTL6BO94805 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTL6BO94805 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTL6BO94805 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTL6BO94805 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTL6BO94805 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTL6BO94805 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTL6BO94805 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTL6BO94805 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTL6BO94805 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTL6BO94805 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTL6BO94805 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTL6BO94805 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTL6BO94805 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTL6BO94805 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTL6BO94805 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTL6BO94805 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTL6BO94805 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTL6BO94805 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTL6BO94805 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTL6BO94805 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTL6BO94805 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTL6BO94805 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTL6BO94805 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTL6BO94805 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTL6BO94805 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTL6BO94805 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTL6BO94805 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTL6BO94805 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTL6BO94805 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTL6BO94805 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTL6BO94805 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTL6BO94805 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms