Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
FLOT1O75955 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
FLOT1O75955 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
FLOT1O75955 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
FLOT1O75955 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
FLOT1O75955 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
FLOT1O75955 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
FLOT1O75955 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
FLOT1O75955 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
FLOT1O75955 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
FLOT1O75955 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
FLOT1O75955 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
FLOT1O75955 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
FLOT1O75955 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
FLOT1O75955 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
FLOT1O75955 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
FLOT1O75955 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
FLOT1O75955 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
FLOT1O75955 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
FLOT1O75955 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
FLOT1O75955 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
FLOT1O75955 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
FLOT1O75955 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
FLOT1O75955 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
FLOT1O75955 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
FLOT1O75955 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
FLOT1O75955 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
FLOT1O75955 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
FLOT1O75955 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
FLOT1O75955 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
FLOT1O75955 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
FLOT1O75955 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
FLOT1O75955 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
FLOT1O75955 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
FLOT1O75955 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
FLOT1O75955 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
FLOT1O75955 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
FLOT1O75955 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
FLOT1O75955 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
FLOT1O75955 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
FLOT1O75955 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
FLOT1O75955 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
FLOT1O75955 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
FLOT1O75955 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
FLOT1O75955 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
FLOT1O75955 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
FLOT1O75955 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
FLOT1O75955 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
FLOT1O75955 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.15■■■□□ 2.9
FLOT1O75955 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
FLOT1O75955 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
FLOT1O75955 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
FLOT1O75955 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
FLOT1O75955 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
FLOT1O75955 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
FLOT1O75955 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
FLOT1O75955 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
FLOT1O75955 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
FLOT1O75955 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
FLOT1O75955 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
FLOT1O75955 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
FLOT1O75955 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
FLOT1O75955 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
FLOT1O75955 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
FLOT1O75955 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
FLOT1O75955 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
FLOT1O75955 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
FLOT1O75955 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
FLOT1O75955 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
FLOT1O75955 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
FLOT1O75955 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
FLOT1O75955 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
FLOT1O75955 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
FLOT1O75955 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
FLOT1O75955 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
FLOT1O75955 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
FLOT1O75955 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
FLOT1O75955 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
FLOT1O75955 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
FLOT1O75955 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
FLOT1O75955 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
FLOT1O75955 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
FLOT1O75955 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
FLOT1O75955 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
FLOT1O75955 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
FLOT1O75955 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
FLOT1O75955 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
FLOT1O75955 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
FLOT1O75955 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
FLOT1O75955 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
FLOT1O75955 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
FLOT1O75955 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
FLOT1O75955 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
FLOT1O75955 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
FLOT1O75955 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
FLOT1O75955 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
FLOT1O75955 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FLOT1O75955 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
FLOT1O75955 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
FLOT1O75955 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms