Protein–RNA interactions for Protein: O43933

PEX1, Peroxisome biogenesis factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX1O43933 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PEX1O43933 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PEX1O43933 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PEX1O43933 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PEX1O43933 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PEX1O43933 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PEX1O43933 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PEX1O43933 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PEX1O43933 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PEX1O43933 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PEX1O43933 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PEX1O43933 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PEX1O43933 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PEX1O43933 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PEX1O43933 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PEX1O43933 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PEX1O43933 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PEX1O43933 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PEX1O43933 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PEX1O43933 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PEX1O43933 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PEX1O43933 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PEX1O43933 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PEX1O43933 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PEX1O43933 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PEX1O43933 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PEX1O43933 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PEX1O43933 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PEX1O43933 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
PEX1O43933 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PEX1O43933 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PEX1O43933 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PEX1O43933 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PEX1O43933 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PEX1O43933 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PEX1O43933 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PEX1O43933 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PEX1O43933 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PEX1O43933 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PEX1O43933 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PEX1O43933 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PEX1O43933 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PEX1O43933 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PEX1O43933 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PEX1O43933 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PEX1O43933 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PEX1O43933 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PEX1O43933 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PEX1O43933 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PEX1O43933 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PEX1O43933 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PEX1O43933 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PEX1O43933 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PEX1O43933 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PEX1O43933 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PEX1O43933 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PEX1O43933 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PEX1O43933 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PEX1O43933 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PEX1O43933 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PEX1O43933 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PEX1O43933 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PEX1O43933 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PEX1O43933 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PEX1O43933 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PEX1O43933 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PEX1O43933 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PEX1O43933 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PEX1O43933 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PEX1O43933 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PEX1O43933 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PEX1O43933 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PEX1O43933 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PEX1O43933 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PEX1O43933 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PEX1O43933 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PEX1O43933 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PEX1O43933 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PEX1O43933 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PEX1O43933 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PEX1O43933 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PEX1O43933 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PEX1O43933 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
PEX1O43933 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PEX1O43933 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PEX1O43933 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PEX1O43933 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PEX1O43933 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PEX1O43933 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PEX1O43933 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PEX1O43933 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PEX1O43933 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PEX1O43933 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PEX1O43933 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PEX1O43933 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PEX1O43933 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PEX1O43933 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PEX1O43933 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PEX1O43933 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PEX1O43933 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms