Protein–RNA interactions for Protein: O43795

MYO1B, Unconventional myosin-Ib, humanhuman

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1BO43795 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
MYO1BO43795 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
MYO1BO43795 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
MYO1BO43795 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
MYO1BO43795 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
MYO1BO43795 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
MYO1BO43795 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
MYO1BO43795 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
MYO1BO43795 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
MYO1BO43795 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
MYO1BO43795 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
MYO1BO43795 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
MYO1BO43795 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
MYO1BO43795 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
MYO1BO43795 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
MYO1BO43795 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
MYO1BO43795 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
MYO1BO43795 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
MYO1BO43795 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
MYO1BO43795 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
MYO1BO43795 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
MYO1BO43795 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
MYO1BO43795 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
MYO1BO43795 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
MYO1BO43795 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
MYO1BO43795 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
MYO1BO43795 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
MYO1BO43795 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
MYO1BO43795 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
MYO1BO43795 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
MYO1BO43795 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
MYO1BO43795 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
MYO1BO43795 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
MYO1BO43795 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
MYO1BO43795 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
MYO1BO43795 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
MYO1BO43795 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
MYO1BO43795 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
MYO1BO43795 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
MYO1BO43795 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
MYO1BO43795 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
MYO1BO43795 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.66■■■■□ 3.14
MYO1BO43795 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
MYO1BO43795 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
MYO1BO43795 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
MYO1BO43795 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
MYO1BO43795 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
MYO1BO43795 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
MYO1BO43795 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
MYO1BO43795 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
MYO1BO43795 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
MYO1BO43795 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
MYO1BO43795 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
MYO1BO43795 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
MYO1BO43795 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
MYO1BO43795 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
MYO1BO43795 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
MYO1BO43795 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
MYO1BO43795 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
MYO1BO43795 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
MYO1BO43795 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
MYO1BO43795 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
MYO1BO43795 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
MYO1BO43795 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
MYO1BO43795 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
MYO1BO43795 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
MYO1BO43795 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
MYO1BO43795 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
MYO1BO43795 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
MYO1BO43795 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
MYO1BO43795 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
MYO1BO43795 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
MYO1BO43795 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
MYO1BO43795 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
MYO1BO43795 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
MYO1BO43795 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
MYO1BO43795 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
MYO1BO43795 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
MYO1BO43795 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
MYO1BO43795 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
MYO1BO43795 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
MYO1BO43795 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
MYO1BO43795 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
MYO1BO43795 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
MYO1BO43795 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
MYO1BO43795 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
MYO1BO43795 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
MYO1BO43795 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
MYO1BO43795 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
MYO1BO43795 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
MYO1BO43795 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
MYO1BO43795 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
MYO1BO43795 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
MYO1BO43795 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
MYO1BO43795 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
MYO1BO43795 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
MYO1BO43795 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
MYO1BO43795 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
MYO1BO43795 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
MYO1BO43795 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms