Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNA1GO43497 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNA1GO43497 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CACNA1GO43497 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CACNA1GO43497 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CACNA1GO43497 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CACNA1GO43497 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CACNA1GO43497 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CACNA1GO43497 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNA1GO43497 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNA1GO43497 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CACNA1GO43497 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CACNA1GO43497 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CACNA1GO43497 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CACNA1GO43497 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CACNA1GO43497 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CACNA1GO43497 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNA1GO43497 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNA1GO43497 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CACNA1GO43497 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CACNA1GO43497 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CACNA1GO43497 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CACNA1GO43497 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA1GO43497 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CACNA1GO43497 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNA1GO43497 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CACNA1GO43497 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CACNA1GO43497 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CACNA1GO43497 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CACNA1GO43497 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CACNA1GO43497 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CACNA1GO43497 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CACNA1GO43497 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CACNA1GO43497 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNA1GO43497 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CACNA1GO43497 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNA1GO43497 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNA1GO43497 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNA1GO43497 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNA1GO43497 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNA1GO43497 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNA1GO43497 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNA1GO43497 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNA1GO43497 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNA1GO43497 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNA1GO43497 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNA1GO43497 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNA1GO43497 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNA1GO43497 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNA1GO43497 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNA1GO43497 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNA1GO43497 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNA1GO43497 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CACNA1GO43497 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CACNA1GO43497 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNA1GO43497 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNA1GO43497 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNA1GO43497 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNA1GO43497 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNA1GO43497 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNA1GO43497 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNA1GO43497 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNA1GO43497 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNA1GO43497 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNA1GO43497 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNA1GO43497 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNA1GO43497 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNA1GO43497 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
CACNA1GO43497 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CACNA1GO43497 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CACNA1GO43497 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNA1GO43497 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNA1GO43497 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNA1GO43497 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNA1GO43497 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CACNA1GO43497 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CACNA1GO43497 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNA1GO43497 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNA1GO43497 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNA1GO43497 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNA1GO43497 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNA1GO43497 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNA1GO43497 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNA1GO43497 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CACNA1GO43497 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNA1GO43497 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNA1GO43497 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CACNA1GO43497 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNA1GO43497 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CACNA1GO43497 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CACNA1GO43497 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNA1GO43497 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNA1GO43497 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNA1GO43497 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNA1GO43497 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNA1GO43497 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNA1GO43497 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNA1GO43497 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNA1GO43497 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNA1GO43497 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms