Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF1O43189 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF1O43189 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF1O43189 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF1O43189 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHF1O43189 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHF1O43189 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF1O43189 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF1O43189 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF1O43189 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF1O43189 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF1O43189 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF1O43189 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF1O43189 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF1O43189 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF1O43189 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF1O43189 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF1O43189 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF1O43189 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF1O43189 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF1O43189 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF1O43189 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF1O43189 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF1O43189 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF1O43189 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF1O43189 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF1O43189 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF1O43189 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF1O43189 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF1O43189 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF1O43189 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF1O43189 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF1O43189 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF1O43189 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF1O43189 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF1O43189 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF1O43189 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF1O43189 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF1O43189 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF1O43189 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF1O43189 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF1O43189 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF1O43189 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF1O43189 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF1O43189 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF1O43189 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF1O43189 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF1O43189 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF1O43189 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF1O43189 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF1O43189 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF1O43189 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF1O43189 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF1O43189 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF1O43189 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF1O43189 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF1O43189 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHF1O43189 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF1O43189 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF1O43189 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF1O43189 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHF1O43189 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHF1O43189 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF1O43189 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHF1O43189 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF1O43189 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF1O43189 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF1O43189 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF1O43189 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF1O43189 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF1O43189 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF1O43189 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF1O43189 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF1O43189 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF1O43189 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF1O43189 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF1O43189 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF1O43189 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF1O43189 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF1O43189 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF1O43189 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF1O43189 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF1O43189 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF1O43189 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF1O43189 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF1O43189 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF1O43189 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF1O43189 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF1O43189 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF1O43189 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF1O43189 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF1O43189 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF1O43189 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF1O43189 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF1O43189 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHF1O43189 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHF1O43189 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PHF1O43189 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHF1O43189 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PHF1O43189 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms