Protein–RNA interactions for Protein: O14958

CASQ2, Calsequestrin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ2O14958 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CASQ2O14958 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASQ2O14958 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASQ2O14958 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASQ2O14958 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASQ2O14958 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CASQ2O14958 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CASQ2O14958 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CASQ2O14958 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CASQ2O14958 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CASQ2O14958 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CASQ2O14958 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CASQ2O14958 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CASQ2O14958 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CASQ2O14958 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CASQ2O14958 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CASQ2O14958 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CASQ2O14958 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CASQ2O14958 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CASQ2O14958 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CASQ2O14958 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CASQ2O14958 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CASQ2O14958 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CASQ2O14958 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CASQ2O14958 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CASQ2O14958 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASQ2O14958 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CASQ2O14958 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASQ2O14958 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASQ2O14958 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CASQ2O14958 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CASQ2O14958 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASQ2O14958 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASQ2O14958 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CASQ2O14958 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CASQ2O14958 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASQ2O14958 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CASQ2O14958 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASQ2O14958 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CASQ2O14958 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASQ2O14958 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CASQ2O14958 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CASQ2O14958 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASQ2O14958 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASQ2O14958 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CASQ2O14958 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CASQ2O14958 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CASQ2O14958 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CASQ2O14958 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASQ2O14958 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASQ2O14958 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASQ2O14958 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASQ2O14958 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CASQ2O14958 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASQ2O14958 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASQ2O14958 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASQ2O14958 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASQ2O14958 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASQ2O14958 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASQ2O14958 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASQ2O14958 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASQ2O14958 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASQ2O14958 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASQ2O14958 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASQ2O14958 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASQ2O14958 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASQ2O14958 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASQ2O14958 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASQ2O14958 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASQ2O14958 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASQ2O14958 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CASQ2O14958 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CASQ2O14958 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASQ2O14958 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASQ2O14958 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASQ2O14958 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASQ2O14958 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASQ2O14958 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASQ2O14958 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASQ2O14958 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASQ2O14958 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASQ2O14958 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASQ2O14958 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASQ2O14958 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASQ2O14958 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASQ2O14958 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASQ2O14958 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASQ2O14958 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASQ2O14958 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASQ2O14958 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASQ2O14958 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASQ2O14958 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASQ2O14958 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASQ2O14958 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CASQ2O14958 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASQ2O14958 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASQ2O14958 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASQ2O14958 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASQ2O14958 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CASQ2O14958 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms