Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC52.26■■■■■ 5.96
CUX2O14529 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.24■■■■■ 5.95
CUX2O14529 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC52.23■■■■■ 5.95
CUX2O14529 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.22■■■■■ 5.95
CUX2O14529 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC52.18■■■■■ 5.94
CUX2O14529 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.12■■■■■ 5.93
CUX2O14529 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.08■■■■■ 5.93
CUX2O14529 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC51.92■■■■■ 5.9
CUX2O14529 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.92■■■■■ 5.9
CUX2O14529 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC51.92■■■■■ 5.9
CUX2O14529 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.88■■■■■ 5.9
CUX2O14529 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC51.87■■■■■ 5.89
CUX2O14529 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.86■■■■■ 5.89
CUX2O14529 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC51.84■■■■■ 5.89
CUX2O14529 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.8■■■■■ 5.88
CUX2O14529 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC51.75■■■■■ 5.88
CUX2O14529 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC51.73■■■■■ 5.87
CUX2O14529 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC51.67■■■■■ 5.86
CUX2O14529 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.65■■■■■ 5.86
CUX2O14529 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.61■■■■■ 5.85
CUX2O14529 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.61■■■■■ 5.85
CUX2O14529 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC51.57■■■■■ 5.85
CUX2O14529 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.55■■■■■ 5.84
CUX2O14529 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC51.54■■■■■ 5.84
CUX2O14529 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC51.53■■■■■ 5.84
CUX2O14529 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.52■■■■■ 5.84
CUX2O14529 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC51.52■■■■■ 5.84
CUX2O14529 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC51.5■■■■■ 5.84
CUX2O14529 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.49■■■■■ 5.83
CUX2O14529 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC51.36■■■■■ 5.81
CUX2O14529 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC51.36■■■■■ 5.81
CUX2O14529 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.34■■■■■ 5.81
CUX2O14529 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC51.32■■■■■ 5.81
CUX2O14529 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC51.32■■■■■ 5.81
CUX2O14529 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC51.29■■■■■ 5.8
CUX2O14529 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.29■■■■■ 5.8
CUX2O14529 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.25■■■■■ 5.79
CUX2O14529 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC51.22■■■■■ 5.79
CUX2O14529 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC51.2■■■■■ 5.79
CUX2O14529 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.16■■■■■ 5.78
CUX2O14529 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC51.16■■■■■ 5.78
CUX2O14529 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.16■■■■■ 5.78
CUX2O14529 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC51.15■■■■■ 5.78
CUX2O14529 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC51.13■■■■■ 5.78
CUX2O14529 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC51.09■■■■■ 5.77
CUX2O14529 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.08■■■■■ 5.77
CUX2O14529 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC51.07■■■■■ 5.77
CUX2O14529 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC51.03■■■■■ 5.76
CUX2O14529 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC50.99■■■■■ 5.75
CUX2O14529 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC50.97■■■■■ 5.75
CUX2O14529 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC50.95■■■■■ 5.75
CUX2O14529 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC50.95■■■■■ 5.75
CUX2O14529 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC50.94■■■■■ 5.75
CUX2O14529 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.88■■■■■ 5.74
CUX2O14529 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC50.88■■■■■ 5.74
CUX2O14529 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.88■■■■■ 5.74
CUX2O14529 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC50.86■■■■■ 5.73
CUX2O14529 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC50.84■■■■■ 5.73
CUX2O14529 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC50.78■■■■■ 5.72
CUX2O14529 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC50.78■■■■■ 5.72
CUX2O14529 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.78■■■■■ 5.72
CUX2O14529 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC50.78■■■■■ 5.72
CUX2O14529 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.74■■■■■ 5.71
CUX2O14529 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC50.71■■■■■ 5.71
CUX2O14529 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC50.65■■■■■ 5.7
CUX2O14529 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC50.64■■■■■ 5.7
CUX2O14529 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC50.61■■■■■ 5.69
CUX2O14529 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC50.6■■■■■ 5.69
CUX2O14529 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC50.6■■■■■ 5.69
CUX2O14529 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC50.59■■■■■ 5.69
CUX2O14529 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.54■■■■■ 5.68
CUX2O14529 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.54■■■■■ 5.68
CUX2O14529 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC50.51■■■■■ 5.68
CUX2O14529 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.5■■■■■ 5.67
CUX2O14529 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC50.5■■■■■ 5.67
CUX2O14529 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC50.48■■■■■ 5.67
CUX2O14529 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC50.47■■■■■ 5.67
CUX2O14529 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.46■■■■■ 5.67
CUX2O14529 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC50.43■■■■■ 5.66
CUX2O14529 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC50.39■■■■■ 5.66
CUX2O14529 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC50.37■■■■■ 5.65
CUX2O14529 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.34■■■■■ 5.65
CUX2O14529 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC50.31■■■■■ 5.64
CUX2O14529 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC50.27■■■■■ 5.64
CUX2O14529 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC50.27■■■■■ 5.64
CUX2O14529 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.26■■■■■ 5.64
CUX2O14529 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC50.25■■■■■ 5.63
CUX2O14529 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.2■■■■■ 5.63
CUX2O14529 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.2■■■■■ 5.63
CUX2O14529 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.19■■■■■ 5.62
CUX2O14529 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.18■■■■■ 5.62
CUX2O14529 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC50.15■■■■■ 5.62
CUX2O14529 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC50.14■■■■■ 5.62
CUX2O14529 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC50.14■■■■■ 5.62
CUX2O14529 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC50.12■■■■■ 5.61
CUX2O14529 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC50.09■■■■■ 5.61
CUX2O14529 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC50.08■■■■■ 5.61
CUX2O14529 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC50.04■■■■■ 5.6
CUX2O14529 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.01■■■■■ 5.6
CUX2O14529 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC50.01■■■■■ 5.6
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