Protein–RNA interactions for Protein: B2RUY7

VWC2L, von Willebrand factor C domain-containing protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2LB2RUY7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VWC2LB2RUY7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VWC2LB2RUY7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VWC2LB2RUY7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VWC2LB2RUY7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWC2LB2RUY7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VWC2LB2RUY7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VWC2LB2RUY7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VWC2LB2RUY7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VWC2LB2RUY7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWC2LB2RUY7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWC2LB2RUY7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWC2LB2RUY7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VWC2LB2RUY7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VWC2LB2RUY7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWC2LB2RUY7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWC2LB2RUY7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VWC2LB2RUY7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VWC2LB2RUY7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWC2LB2RUY7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VWC2LB2RUY7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VWC2LB2RUY7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VWC2LB2RUY7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VWC2LB2RUY7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VWC2LB2RUY7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VWC2LB2RUY7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VWC2LB2RUY7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VWC2LB2RUY7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VWC2LB2RUY7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VWC2LB2RUY7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VWC2LB2RUY7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VWC2LB2RUY7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VWC2LB2RUY7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VWC2LB2RUY7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VWC2LB2RUY7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VWC2LB2RUY7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VWC2LB2RUY7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VWC2LB2RUY7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VWC2LB2RUY7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VWC2LB2RUY7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VWC2LB2RUY7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VWC2LB2RUY7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VWC2LB2RUY7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWC2LB2RUY7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWC2LB2RUY7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWC2LB2RUY7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VWC2LB2RUY7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VWC2LB2RUY7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VWC2LB2RUY7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VWC2LB2RUY7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VWC2LB2RUY7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VWC2LB2RUY7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VWC2LB2RUY7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VWC2LB2RUY7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VWC2LB2RUY7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VWC2LB2RUY7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
VWC2LB2RUY7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
VWC2LB2RUY7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VWC2LB2RUY7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VWC2LB2RUY7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VWC2LB2RUY7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VWC2LB2RUY7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VWC2LB2RUY7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VWC2LB2RUY7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VWC2LB2RUY7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VWC2LB2RUY7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VWC2LB2RUY7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
VWC2LB2RUY7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VWC2LB2RUY7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VWC2LB2RUY7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VWC2LB2RUY7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VWC2LB2RUY7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VWC2LB2RUY7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VWC2LB2RUY7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VWC2LB2RUY7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VWC2LB2RUY7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VWC2LB2RUY7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VWC2LB2RUY7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VWC2LB2RUY7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VWC2LB2RUY7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VWC2LB2RUY7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VWC2LB2RUY7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VWC2LB2RUY7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWC2LB2RUY7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWC2LB2RUY7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VWC2LB2RUY7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWC2LB2RUY7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VWC2LB2RUY7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VWC2LB2RUY7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VWC2LB2RUY7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VWC2LB2RUY7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VWC2LB2RUY7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VWC2LB2RUY7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VWC2LB2RUY7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VWC2LB2RUY7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWC2LB2RUY7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VWC2LB2RUY7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWC2LB2RUY7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWC2LB2RUY7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VWC2LB2RUY7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms