Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HMGB1P1B2RPK0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HMGB1P1B2RPK0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HMGB1P1B2RPK0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HMGB1P1B2RPK0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HMGB1P1B2RPK0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HMGB1P1B2RPK0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HMGB1P1B2RPK0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HMGB1P1B2RPK0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HMGB1P1B2RPK0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HMGB1P1B2RPK0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HMGB1P1B2RPK0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HMGB1P1B2RPK0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HMGB1P1B2RPK0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HMGB1P1B2RPK0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HMGB1P1B2RPK0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HMGB1P1B2RPK0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HMGB1P1B2RPK0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HMGB1P1B2RPK0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HMGB1P1B2RPK0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HMGB1P1B2RPK0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HMGB1P1B2RPK0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HMGB1P1B2RPK0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
HMGB1P1B2RPK0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HMGB1P1B2RPK0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HMGB1P1B2RPK0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HMGB1P1B2RPK0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HMGB1P1B2RPK0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HMGB1P1B2RPK0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HMGB1P1B2RPK0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HMGB1P1B2RPK0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HMGB1P1B2RPK0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HMGB1P1B2RPK0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HMGB1P1B2RPK0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HMGB1P1B2RPK0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HMGB1P1B2RPK0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HMGB1P1B2RPK0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HMGB1P1B2RPK0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HMGB1P1B2RPK0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HMGB1P1B2RPK0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HMGB1P1B2RPK0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HMGB1P1B2RPK0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
HMGB1P1B2RPK0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HMGB1P1B2RPK0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HMGB1P1B2RPK0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
HMGB1P1B2RPK0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
HMGB1P1B2RPK0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HMGB1P1B2RPK0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HMGB1P1B2RPK0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HMGB1P1B2RPK0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HMGB1P1B2RPK0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HMGB1P1B2RPK0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HMGB1P1B2RPK0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HMGB1P1B2RPK0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HMGB1P1B2RPK0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HMGB1P1B2RPK0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HMGB1P1B2RPK0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HMGB1P1B2RPK0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HMGB1P1B2RPK0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HMGB1P1B2RPK0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HMGB1P1B2RPK0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HMGB1P1B2RPK0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HMGB1P1B2RPK0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HMGB1P1B2RPK0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HMGB1P1B2RPK0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HMGB1P1B2RPK0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HMGB1P1B2RPK0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HMGB1P1B2RPK0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HMGB1P1B2RPK0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HMGB1P1B2RPK0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HMGB1P1B2RPK0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HMGB1P1B2RPK0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HMGB1P1B2RPK0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HMGB1P1B2RPK0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HMGB1P1B2RPK0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
HMGB1P1B2RPK0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HMGB1P1B2RPK0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HMGB1P1B2RPK0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HMGB1P1B2RPK0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HMGB1P1B2RPK0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HMGB1P1B2RPK0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HMGB1P1B2RPK0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HMGB1P1B2RPK0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HMGB1P1B2RPK0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HMGB1P1B2RPK0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HMGB1P1B2RPK0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HMGB1P1B2RPK0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HMGB1P1B2RPK0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HMGB1P1B2RPK0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HMGB1P1B2RPK0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HMGB1P1B2RPK0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HMGB1P1B2RPK0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HMGB1P1B2RPK0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HMGB1P1B2RPK0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
HMGB1P1B2RPK0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HMGB1P1B2RPK0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HMGB1P1B2RPK0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms