Protein–RNA interactions for Protein: A6NGJ6

TRIM64, Tripartite motif-containing protein 64, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM64A6NGJ6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM64A6NGJ6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM64A6NGJ6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM64A6NGJ6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM64A6NGJ6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM64A6NGJ6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM64A6NGJ6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM64A6NGJ6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM64A6NGJ6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM64A6NGJ6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM64A6NGJ6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM64A6NGJ6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM64A6NGJ6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM64A6NGJ6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM64A6NGJ6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM64A6NGJ6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM64A6NGJ6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM64A6NGJ6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM64A6NGJ6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM64A6NGJ6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM64A6NGJ6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM64A6NGJ6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM64A6NGJ6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM64A6NGJ6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM64A6NGJ6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM64A6NGJ6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM64A6NGJ6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM64A6NGJ6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM64A6NGJ6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM64A6NGJ6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRIM64A6NGJ6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM64A6NGJ6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM64A6NGJ6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM64A6NGJ6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM64A6NGJ6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM64A6NGJ6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM64A6NGJ6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM64A6NGJ6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM64A6NGJ6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM64A6NGJ6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM64A6NGJ6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM64A6NGJ6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM64A6NGJ6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM64A6NGJ6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM64A6NGJ6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM64A6NGJ6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM64A6NGJ6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM64A6NGJ6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM64A6NGJ6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM64A6NGJ6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM64A6NGJ6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM64A6NGJ6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM64A6NGJ6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM64A6NGJ6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM64A6NGJ6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM64A6NGJ6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM64A6NGJ6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM64A6NGJ6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM64A6NGJ6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM64A6NGJ6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM64A6NGJ6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM64A6NGJ6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM64A6NGJ6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM64A6NGJ6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM64A6NGJ6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM64A6NGJ6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM64A6NGJ6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM64A6NGJ6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM64A6NGJ6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM64A6NGJ6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM64A6NGJ6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM64A6NGJ6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM64A6NGJ6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM64A6NGJ6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM64A6NGJ6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM64A6NGJ6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM64A6NGJ6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM64A6NGJ6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM64A6NGJ6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM64A6NGJ6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM64A6NGJ6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM64A6NGJ6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM64A6NGJ6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM64A6NGJ6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TRIM64A6NGJ6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TRIM64A6NGJ6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM64A6NGJ6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM64A6NGJ6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM64A6NGJ6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM64A6NGJ6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM64A6NGJ6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM64A6NGJ6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM64A6NGJ6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM64A6NGJ6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM64A6NGJ6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM64A6NGJ6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM64A6NGJ6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM64A6NGJ6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM64A6NGJ6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM64A6NGJ6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.3 ms