Protein–RNA interactions for Protein: A6NFX1

MFSD2B, Major facilitator superfamily domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2BA6NFX1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MFSD2BA6NFX1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MFSD2BA6NFX1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MFSD2BA6NFX1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MFSD2BA6NFX1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MFSD2BA6NFX1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MFSD2BA6NFX1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MFSD2BA6NFX1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MFSD2BA6NFX1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MFSD2BA6NFX1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MFSD2BA6NFX1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MFSD2BA6NFX1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MFSD2BA6NFX1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MFSD2BA6NFX1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MFSD2BA6NFX1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MFSD2BA6NFX1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MFSD2BA6NFX1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MFSD2BA6NFX1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MFSD2BA6NFX1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MFSD2BA6NFX1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MFSD2BA6NFX1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MFSD2BA6NFX1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MFSD2BA6NFX1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MFSD2BA6NFX1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MFSD2BA6NFX1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MFSD2BA6NFX1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MFSD2BA6NFX1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MFSD2BA6NFX1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MFSD2BA6NFX1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MFSD2BA6NFX1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MFSD2BA6NFX1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MFSD2BA6NFX1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MFSD2BA6NFX1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MFSD2BA6NFX1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MFSD2BA6NFX1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MFSD2BA6NFX1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MFSD2BA6NFX1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MFSD2BA6NFX1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MFSD2BA6NFX1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MFSD2BA6NFX1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MFSD2BA6NFX1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MFSD2BA6NFX1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MFSD2BA6NFX1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MFSD2BA6NFX1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MFSD2BA6NFX1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MFSD2BA6NFX1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD2BA6NFX1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MFSD2BA6NFX1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MFSD2BA6NFX1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MFSD2BA6NFX1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MFSD2BA6NFX1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MFSD2BA6NFX1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MFSD2BA6NFX1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MFSD2BA6NFX1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD2BA6NFX1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MFSD2BA6NFX1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MFSD2BA6NFX1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MFSD2BA6NFX1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MFSD2BA6NFX1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MFSD2BA6NFX1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MFSD2BA6NFX1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MFSD2BA6NFX1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MFSD2BA6NFX1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MFSD2BA6NFX1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MFSD2BA6NFX1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MFSD2BA6NFX1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MFSD2BA6NFX1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MFSD2BA6NFX1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MFSD2BA6NFX1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MFSD2BA6NFX1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MFSD2BA6NFX1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MFSD2BA6NFX1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MFSD2BA6NFX1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MFSD2BA6NFX1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MFSD2BA6NFX1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MFSD2BA6NFX1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MFSD2BA6NFX1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MFSD2BA6NFX1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MFSD2BA6NFX1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MFSD2BA6NFX1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MFSD2BA6NFX1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD2BA6NFX1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MFSD2BA6NFX1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MFSD2BA6NFX1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MFSD2BA6NFX1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFSD2BA6NFX1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFSD2BA6NFX1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD2BA6NFX1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD2BA6NFX1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFSD2BA6NFX1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFSD2BA6NFX1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFSD2BA6NFX1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MFSD2BA6NFX1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MFSD2BA6NFX1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MFSD2BA6NFX1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MFSD2BA6NFX1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MFSD2BA6NFX1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFSD2BA6NFX1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFSD2BA6NFX1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MFSD2BA6NFX1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms