Protein–RNA interactions for Protein: A6NFX1

MFSD2B, Major facilitator superfamily domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2BA6NFX1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MFSD2BA6NFX1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MFSD2BA6NFX1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MFSD2BA6NFX1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MFSD2BA6NFX1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MFSD2BA6NFX1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MFSD2BA6NFX1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MFSD2BA6NFX1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MFSD2BA6NFX1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MFSD2BA6NFX1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MFSD2BA6NFX1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MFSD2BA6NFX1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MFSD2BA6NFX1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MFSD2BA6NFX1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MFSD2BA6NFX1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MFSD2BA6NFX1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MFSD2BA6NFX1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MFSD2BA6NFX1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MFSD2BA6NFX1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MFSD2BA6NFX1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MFSD2BA6NFX1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MFSD2BA6NFX1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MFSD2BA6NFX1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MFSD2BA6NFX1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MFSD2BA6NFX1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MFSD2BA6NFX1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MFSD2BA6NFX1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MFSD2BA6NFX1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MFSD2BA6NFX1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MFSD2BA6NFX1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MFSD2BA6NFX1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MFSD2BA6NFX1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MFSD2BA6NFX1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MFSD2BA6NFX1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MFSD2BA6NFX1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MFSD2BA6NFX1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MFSD2BA6NFX1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MFSD2BA6NFX1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MFSD2BA6NFX1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MFSD2BA6NFX1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MFSD2BA6NFX1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MFSD2BA6NFX1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MFSD2BA6NFX1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MFSD2BA6NFX1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MFSD2BA6NFX1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MFSD2BA6NFX1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MFSD2BA6NFX1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MFSD2BA6NFX1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MFSD2BA6NFX1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MFSD2BA6NFX1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MFSD2BA6NFX1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MFSD2BA6NFX1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MFSD2BA6NFX1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MFSD2BA6NFX1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MFSD2BA6NFX1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MFSD2BA6NFX1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MFSD2BA6NFX1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MFSD2BA6NFX1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MFSD2BA6NFX1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MFSD2BA6NFX1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MFSD2BA6NFX1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MFSD2BA6NFX1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MFSD2BA6NFX1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MFSD2BA6NFX1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MFSD2BA6NFX1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MFSD2BA6NFX1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MFSD2BA6NFX1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MFSD2BA6NFX1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MFSD2BA6NFX1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MFSD2BA6NFX1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MFSD2BA6NFX1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MFSD2BA6NFX1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MFSD2BA6NFX1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MFSD2BA6NFX1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MFSD2BA6NFX1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MFSD2BA6NFX1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD2BA6NFX1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD2BA6NFX1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MFSD2BA6NFX1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MFSD2BA6NFX1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD2BA6NFX1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD2BA6NFX1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD2BA6NFX1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD2BA6NFX1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MFSD2BA6NFX1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MFSD2BA6NFX1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MFSD2BA6NFX1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MFSD2BA6NFX1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MFSD2BA6NFX1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MFSD2BA6NFX1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MFSD2BA6NFX1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MFSD2BA6NFX1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MFSD2BA6NFX1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MFSD2BA6NFX1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MFSD2BA6NFX1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MFSD2BA6NFX1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MFSD2BA6NFX1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MFSD2BA6NFX1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MFSD2BA6NFX1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MFSD2BA6NFX1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms