Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPK0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPK0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A1W2PPK0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A1W2PPK0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A1W2PPK0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A1W2PPK0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A1W2PPK0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A1W2PPK0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A1W2PPK0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A1W2PPK0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1W2PPK0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1W2PPK0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A1W2PPK0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A1W2PPK0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A1W2PPK0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A1W2PPK0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A1W2PPK0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A1W2PPK0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A1W2PPK0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A1W2PPK0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A1W2PPK0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A1W2PPK0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A1W2PPK0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1W2PPK0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A1W2PPK0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A1W2PPK0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A1W2PPK0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A1W2PPK0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A1W2PPK0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A1W2PPK0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A1W2PPK0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A1W2PPK0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A1W2PPK0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A1W2PPK0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A1W2PPK0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A1W2PPK0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
A0A1W2PPK0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A1W2PPK0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A1W2PPK0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A1W2PPK0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A1W2PPK0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A1W2PPK0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A1W2PPK0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A1W2PPK0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A1W2PPK0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A1W2PPK0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A1W2PPK0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A1W2PPK0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A1W2PPK0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A1W2PPK0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
A0A1W2PPK0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A1W2PPK0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A1W2PPK0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A1W2PPK0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A1W2PPK0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A1W2PPK0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A1W2PPK0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
A0A1W2PPK0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1W2PPK0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A1W2PPK0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A1W2PPK0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A1W2PPK0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A1W2PPK0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1W2PPK0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1W2PPK0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A1W2PPK0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1W2PPK0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1W2PPK0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A1W2PPK0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1W2PPK0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A1W2PPK0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A1W2PPK0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A1W2PPK0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A1W2PPK0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A1W2PPK0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A1W2PPK0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A1W2PPK0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A1W2PPK0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A1W2PPK0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A1W2PPK0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A1W2PPK0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A1W2PPK0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
A0A1W2PPK0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A1W2PPK0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A1W2PPK0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A1W2PPK0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A1W2PPK0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
A0A1W2PPK0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A0A1W2PPK0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A1W2PPK0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A0A1W2PPK0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A1W2PPK0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A1W2PPK0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A1W2PPK0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1W2PPK0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A1W2PPK0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1W2PPK0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A1W2PPK0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A1W2PPK0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A1W2PPK0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A1W2PPK0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms