Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQV1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A0A0U1RQV1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
A0A0U1RQV1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A0A0U1RQV1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A0A0U1RQV1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A0A0U1RQV1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A0A0U1RQV1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A0A0U1RQV1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
A0A0U1RQV1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A0A0U1RQV1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A0A0U1RQV1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A0A0U1RQV1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0U1RQV1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0U1RQV1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0U1RQV1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RQV1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RQV1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RQV1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A0A0U1RQV1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A0A0U1RQV1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A0A0U1RQV1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
A0A0U1RQV1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
A0A0U1RQV1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A0A0U1RQV1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A0A0U1RQV1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A0A0U1RQV1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A0A0U1RQV1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A0A0U1RQV1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A0A0U1RQV1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
A0A0U1RQV1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
A0A0U1RQV1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A0A0U1RQV1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
A0A0U1RQV1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A0A0U1RQV1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A0A0U1RQV1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A0A0U1RQV1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A0A0U1RQV1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A0A0U1RQV1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A0A0U1RQV1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A0A0U1RQV1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A0A0U1RQV1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A0A0U1RQV1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A0A0U1RQV1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A0A0U1RQV1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A0A0U1RQV1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A0A0U1RQV1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
A0A0U1RQV1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
A0A0U1RQV1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
A0A0U1RQV1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
A0A0U1RQV1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
A0A0U1RQV1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
A0A0U1RQV1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
A0A0U1RQV1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
A0A0U1RQV1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
A0A0U1RQV1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A0A0U1RQV1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A0A0U1RQV1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A0A0U1RQV1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A0A0U1RQV1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A0A0U1RQV1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
A0A0U1RQV1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
A0A0U1RQV1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
A0A0U1RQV1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A0A0U1RQV1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
A0A0U1RQV1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A0A0U1RQV1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A0A0U1RQV1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A0A0U1RQV1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
A0A0U1RQV1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
A0A0U1RQV1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
A0A0U1RQV1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A0A0U1RQV1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A0A0U1RQV1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A0A0U1RQV1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A0A0U1RQV1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A0A0U1RQV1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A0A0U1RQV1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A0A0U1RQV1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A0A0U1RQV1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A0A0U1RQV1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A0A0U1RQV1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A0A0U1RQV1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A0A0U1RQV1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A0A0U1RQV1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
A0A0U1RQV1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
A0A0U1RQV1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
A0A0U1RQV1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RQV1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RQV1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RQV1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RQV1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RQV1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RQV1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RQV1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RQV1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RQV1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0U1RQV1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0U1RQV1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A0A0U1RQV1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A0A0U1RQV1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms