Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ATG101Q9BSB4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ATG101Q9BSB4 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms