Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms