Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 ZNF142-205ENST00000449707 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 TOR1AIP1-212ENST00000606911 8704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
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VAMP3Q15836 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
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VAMP3Q15836 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
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VAMP3Q15836 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VAMP3Q15836 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
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VAMP3Q15836 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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VAMP3Q15836 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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VAMP3Q15836 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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