Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PUDPQ08623 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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