Protein–RNA interactions for Protein: Q02252

ALDH6A1, Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH6A1Q02252 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALDH6A1Q02252 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms