Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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VLDLRP98155 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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VLDLRP98155 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VLDLRP98155 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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