Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSFA2P28290 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms