Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC7A4O43246 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms