Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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