Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms