Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms